Longitudinaaluuring viiakse läbi kahe piimakarja 120 lehmvasikaga, keda jälgitakse sünnist esimese elukuu lõpuni kahel korral nädalas. Igal visiidil tehakse vasikatele põhjalik kliiniline läbivaatus ning kopsu ultraheliuuring. Katsesse kaasatud vasikatelt kogutakse ninaneelu tampooniproovid, vere- ning roojaproovid esimesel elunädalal kahel korral, et selgitada vasikate tervislik seisund ning määratleda neelupiirkonna baasmikrobioom. Vasika haigestumisel kopsupõletikku kogutakse temalt ning ühelt tervelt kontrollrühma vasikalt trahheobronhiaalloputuse (TBL) proovid. Nii hingamisteedest kogutud kui roojaproovidest tehakse nanopoor-sekveneerimisega mikrobioomi ja viroomi analüüsid. Loomi jälgitakse kogu nende kasvuperioodi ning esimese laktatsiooni lõpuni selgitamaks varase eluperioodi neelupiirkonna mikrobioomi pikaajaline mõju loomade tervisele ja tootlikkusele.